Bueno, esto viene escrito en comillas porque hay algunas cosas que ya se sabían y otras que no.
Iré poniendo las novedades lo más resumido posible para que no se aburran xD

1-. Posiblemente será lanzado a PRINCIPIOS del 2011 (algo conocido)
2-. Las gráficas y el estilo que se presenta en esta entrega es algo totalmente nuevo en la saga (aunque a mí me parece muy similar al Wind Waker)
3-. WiiMotionPluss será parte permanente del juego aunque Aonuma (uno de los colaboradores principales) no estaba totalmente de acuerdo en un principio.
4-. Un item especial de Spirit Tracks hará su aparición en Skyward Sword: el látigo. Esto se debe a que muchos de los trabajadores de la entrega para NDS fueron elegidos para participar en Skyward Sword.
5-. El menú de inventario ha sufrido grandes cambios. Es un tanto díficil de explicar asi que digamos que este será el punto "pendiente".
 6-. El nunchuk servirá no sólo para mover a Link, sino también como escudo (aunque ya se había visto una técnica de espada en Twilight Princess que hacía uso del escudo mediante el nunchuk).
7-. Un elemento de las "antigüedades" de la saga ha regresado: El rayo que lanza la espada de Link. Tal como en A Link To The Past.
8-. Tendrá música orquestada por desición de Miyamoto (creador de TLoZ), porque pensó que si lo hicieron con Mario Galaxy 2 (sí, Miyamoto es el diseñador de este juego) debían hacerlo también con Zelda.
9-. Las pociones podrán ser usadas mientras corres (mientras Link no se nos ahogue creo que estará bien xD)
10-. Link puede correr, escalar paredes y saltar (es algo que no me tiene del todo convencida, pero habrá que probarlo). Eso sí, estas acciones no serán eternas: Link tendrá una barra de poder que indicará hasta cuando podrá mantenerse haciendo esto.
11-. El Escarabajo: como fue mostrado en el E3, este es un nuevo item que le hará compañía a Link.
12-. La historia se desarrolla en las nubes y en la tierra y es la espada la que posee el poder de llevar a Link de uno al otro "mundo".
13-. ¿Recuerdan el arte oficial que se mostró el año pasado? Bueno, ella es la Skyward Sword (me recuerda a Minish Cap, cuando el amable Minish Estero se convertía en una masa extraña que al final pasó a ser el sombrero de Link). Esta chica se une a Link porque dice que está en busca de un amigo perdido.
14-. La Skyward Sword se convierte en ¡la Master Sword! (algo que realmente esperaba xD) Confirmado por Miyamoto, la Skyward Sword en cierto punto del juego se transforma en la Master Sword. No sabemos como sucede esto, pero es uno de los enigmas mas grandes de Skyward Sword.

Eso sería todo por ahora. A medida que vayan apareciendo más novedades las podrán ir leyendo por aquí ;)